16 апреля и 18 мая 2016 года в Эквадоре произошло два землетрясения, в результате которых, по оценкам, погиб 671 человек и пострадали еще 17 638 людей. 

Более 33 360 жителей страны были вынуждены покинуть свои полностью или частично разрушенные дома и поселиться в приютах.

После первого землетрясения магнитудой 7,8 в Эквадор прибыли четыре сотрудника MSF, работавшие в Южной Африке. В течение месяца они оказывали помощь населению в провинциях Манаби и Эсмеральда — двух из четырех регионов, пострадавших от землетрясения, которые позднее были объявлены районами стихийного бедствия.

После первой оценки ситуации команды MSF сосредоточили усилия на оказании медицинский помощи и выдаче предметов первой необходимости.

Они оказали психологическую помощь 3675 людям и раздали 180 наборов личной гигиены, около 200 наборов для приготовления пищи, более 60 наборов для укрытия (включающие матрасы, одеяла и полиэтиленовые навесы), а также 10 цистерн воды вместимостью 5000 литров каждая. MSF также провела 120 консультаций по первичной медицинской помощи.

В Джаме, прибрежном городе в провинции Манаби, команда MSF раздала наборы для укрытия, приготовления пищи и личной гигиены 500 семьям и в общей сложности оказала помощь 2000 людей. В конце мая MSF завершила свою деятельность в Эквадоре.

MSF начала работать в Эквадоре в 1980 году.